José María Bermúdez de Castro Risueño es Profesor de Investigación del Consejo Superior de Investigaciones Científicas, aunque en la actualidad coordina un Programa de Investigación en el Centro Nacional de Investigación sobre la Evolución Humana de Burgos, que dirigió desde su creación, en 2004, hasta Diciembre de 2012. José María Bermúdez de Castro es co-director de las excavaciones e investigaciones en los yacimientos de la sierra de Atapuerca, y comparte la vicepresidencia de la Fundación Atapuerca con sus compañeros Juan Luís Arsuaga y Eudald Carbonell.